Genom HCV diwakili oleh RNA bermuatan positif untai tunggal, yang mengkode 3 protein struktural (inti protein nukleokapsid dan nukleoprotein selubung E1-E2) dan 5 protein struktural (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5). AT disintesis untuk masing-masing protein ini, yang ditemukan dalam darah pasien dengan hepatitis C virus.