Analisis mengungkapkan bukti baru tentang lonjakan global infeksi streptokokus grup A

Streptococcus Grup A (Strep A) adalah jenis bakteri umum yang biasanya menyebabkan infeksi tenggorokan dan demam berdarah. Meskipun sebagian besar infeksi bersifat ringan, dalam kasus yang jarang terjadi, Strep A dapat menyebabkan infeksi invasif yang dapat berakibat fatal.

Antara tahun 2022 dan 2023, layanan kesehatan di seluruh dunia mencatat lonjakan infeksi Strep A invasif yang parah setelah pembatasan pandemi dicabut. Sebuah studi baru oleh para ilmuwan di Imperial College London dan Public Health England telah mengonfirmasi bahwa varian bakteri yang disebut M1UK memainkan peran penting dalam peningkatan tersebut.

Strain M1 diketahui menyebabkan infeksi yang lebih invasif daripada jenis Strep A lainnya. Meskipun varian ini pertama kali diidentifikasi dan diurutkan di Inggris, M1UK baru-baru ini dikaitkan dengan peningkatan infeksi parah di Eropa, Australia, Amerika Utara, dan Jepang setelah pencabutan pembatasan pandemi. Varian ini juga telah terdeteksi di Amerika Selatan, Selandia Baru, dan Taiwan.

Tingkat infeksi Strep A yang rendah selama pandemi kemungkinan membuat masyarakat, khususnya anak-anak, sangat rentan terhadap infeksi ini, sehingga berkontribusi terhadap lonjakan kasus di banyak negara.

Dalam studi baru tentang genetika M1UK, yang diterbitkan dalam jurnal Nature Communications, para ilmuwan menyajikan data baru tentang kapan varian tersebut pertama kali muncul dan bagaimana perbandingannya dengan strain lain.

Distribusi global dan potensi kejadian introduksi M1UK dan populasi intermediet. Pohon filogenetik dari 2.364 galur M1UK dan intermediet yang dikumpulkan di seluruh dunia dari Maret 2005 hingga Juli 2023. B Pohon penularan yang disederhanakan yang dibuat dengan PastML yang menunjukkan lokasi asal epidemi leluhur dari garis keturunan M1UK dan populasi intermediet. C Perkiraan ukuran populasi efektif (Ne) M1UK di Inggris dari waktu ke waktu. Nature Communications (2024). DOI: 10.1038/s41467-024-47929-7

Dengan menggunakan pengurutan genetik sampel pasien yang dikombinasikan dengan pemodelan komputer, mereka menemukan bahwa M1UK kemungkinan muncul sekitar tahun 2008 dan mulai meningkat secara bertahap mulai tahun 2010 dan seterusnya.

Dibandingkan dengan galur M1 sebelumnya, yang relatif tidak berubah selama 40 tahun terakhir, M1UK menghasilkan lebih banyak racun yang menyebabkan demam berdarah.

Profesor Shiranee Sriskandan, dari Departemen Penyakit Menular Imperial College London, yang memimpin penelitian tersebut bersama rekan-rekannya dari UKHSA, mengatakan: “Bakteri berevolusi seiring waktu dan karena Strep A merupakan patogen yang hanya menyerang manusia, bakteri tersebut mengalami perubahan genetik saat menyebar melalui populasi. Sebagian besar varian muncul dan menghilang seiring waktu, tetapi M1UK kini tampaknya sudah mapan di Inggris dan negara-negara lain. Apakah hal ini akan tetap terjadi dalam jangka panjang masih belum diketahui.”

Sejarah Genetik

Dengan menggunakan penelusuran basis data genomik global, tim tersebut menunjukkan bahwa ketika M1UK pertama kali terdeteksi di Inggris pada tahun 2019, hanya dua galur M1UK yang dapat diidentifikasi dari sekuens genomik di luar Inggris. Namun, analisis selanjutnya dari negara lain, yang meneliti perubahan tren infeksi Strep A (termasuk infeksi invasif), menunjukkan bahwa M1UK kini hadir di lebih dari 10 negara di seluruh dunia dan dalam beberapa kasus telah menjadi galur dominan pascapandemi.

Analisis tersebut juga menyoroti efek kemacetan, dengan infeksi Strep A menurun selama pandemi COVID-19, bertepatan dengan tindakan pembatasan sosial dan karantina wilayah yang meluas. Namun setelah periode ini, M1UK menyebar dengan cepat di Inggris, dengan peningkatan tajam pada demam berdarah dan infeksi Strep A invasif pada tahun 2022.

Menurut para peneliti, meskipun penularan Strep A yang berkurang selama pandemi mungkin telah menyebabkan kekebalan yang melemah pada populasi, penelitian mereka menyoroti fitur genetik M1UK yang menunjukkan keunggulan bertahan hidup dibandingkan jenis lain, yang memungkinkannya menyebar lebih mudah dan berpotensi menyebabkan penyakit yang lebih parah. Ada kemungkinan bahwa kekebalan populasi yang meningkat terhadap jenis M1UK dapat memungkinkan munculnya jenis jenis lain.

Profesor Sriskandan, yang juga direktur klinis Pusat Biologi Resistensi Bakteri, menambahkan: “Meskipun kita sekarang tahu bahwa varian M1UK bertanggung jawab atas peningkatan kasus yang signifikan pada musim dingin lalu, hal ini terjadi pada waktu yang tidak biasa dalam setahun, bertepatan dengan virus pernapasan dan stres musim dingin, yang semuanya berdampak pada tingkat keparahan. Pada akhirnya, lonjakan yang kita lihat pada waktu yang berbeda di seluruh dunia kemungkinan besar disebabkan oleh berkurangnya kekebalan terhadap patogen pernapasan tertentu, khususnya Strep A. Vaksin dapat membantu mencegah hal ini, dan kita benar-benar membutuhkan vaksin untuk melawan Strep A. Temuan terbaru dari penelitian kami ini dimungkinkan oleh kolaborasi erat antara peneliti penyakit menular di Imperial College dan sistem pengawasan molekuler terkemuka di dunia milik Badan Perlindungan Kesehatan Inggris.”