Studi menemukan bakteri terkait dengan kelahiran prematur

Para peneliti di North Carolina State University telah menemukan bahwa beberapa spesies Gardnerella, bakteri yang terkadang dikaitkan dengan bacterial vaginosis (BV) dan persalinan prematur, dapat hidup berdampingan di vagina yang sama mikrobioma. Temuan ini, yang dipublikasikan di jurnal mSystems, menambah pemahaman yang berkembang tentang dampak Gardnerella terhadap kesehatan manusia.

Gardnerella adalah sekelompok bakteri anaerob yang umumnya ditemukan di mikrobioma vagina. Peningkatan kadar bakteri ini merupakan ciri khas BV dan dikaitkan dengan peningkatan risiko kelahiran prematur, namun bakteri ini juga ditemukan pada wanita yang tidak memiliki bukti penyakit tersebut.

"Kami mencoba memahami keragaman dalam Gardnerella," kata Ben Callahan, asisten profesor kesehatan populasi dan patobiologi di North Carolina State University dan salah satu penulis makalah ini.

"Para ilmuwan baru saja mulai mempelajari masing-masing spesies Gardnerella, jadi kami belum mengetahui apakah spesies yang berbeda mungkin mempunyai efek kesehatan yang berbeda. Tujuan utama kami adalah mempelajari ekologi Gardnerella."

Tantangan unik dalam mengurutkan mikrobioma vagina adalah bahwa setiap sampel sebagian besar terdiri dari DNA inang, sehingga ekstraksi data mikroba menjadi lebih mahal dan memakan waktu. Tugas pertama tim peneliti adalah mengembangkan metodologi untuk mengidentifikasi berbagai spesies Gardnerella dari data mikrobioma.

"Alat yang ada saat ini untuk mempelajari mikrobioma vagina memperlakukan semua Gardnerella sebagai satu spesies," kata Hannah Berman, peneliti pascadoktoral di North Carolina State University dan penulis utama makalah tersebut. "Untuk melakukan pekerjaan ini, kami harus membangun database genom Gardnerella kami sendiri dan mengembangkan metode untuk mengidentifikasi berbagai spesies Gardnerella. Mudah-mudahan, ini juga akan memungkinkan lebih banyak peneliti mempelajari keanekaragaman Gardnerella."

Tim peneliti memeriksa data sekuensing dari tiga kelompok: dua populasi acak wanita hamil dan satu populasi dengan riwayat kelahiran prematur. Mereka menganalisis urutan metagenomik Gardnerella dari sampel untuk melihat apakah ada hubungan antara spesies Gardnerella tertentu dan kelahiran prematur.

Meskipun mereka tidak menemukan buktinya, mereka membuat dua penemuan mengejutkan.

Pertama, mereka mengidentifikasi spesies Gardnerella ke-14 yang potensial di antara sampel — hanya 13 spesies yang telah diidentifikasi sebelum penelitian ini dilakukan.

Mereka juga menemukan bahwa di sebagian besar sampel yang mengandung Gardnerella, beberapa spesies Gardnerella hidup berdampingan dalam mikrobioma yang sama: dua hingga 14 spesies Gardnerella yang diketahui ditemukan dalam sampel individu.

"Biasanya, jika suatu spesies bakteri berkolonisasi di lingkungan, kami memperkirakan bakteri tersebut akan mengecualikan kerabat dekatnya yang menempati relung ekologi yang sama dan mengonsumsi sumber daya yang sama," kata Callahan. "Saya sering mengatakan bahwa segala sesuatu mungkin terjadi pada bakteri, namun hal ini tetap tidak biasa. Kami juga melihat bahwa ketika jumlah mikroba secara keseluruhan lebih tinggi, Gardnerella mengambil porsi besar dari jumlah tersebut.

"Bukti terus bertambah bahwa Gardnerella dikaitkan dengan kelahiran prematur, namun detail hubungannya sangat kompleks. Kami tidak menemukan satu pun spesies Gardnerella yang berbahaya dalam penelitian ini—mungkin saja semuanya berbahaya. Itu bukanlah akhir dari segalanya. Dari cerita itu." p>

Para peneliti berharap dapat mempelajari lebih lanjut masalah koeksistensi spesies dan komposisi mikrobioma.

"Mikrobioma vagina diremehkan," kata Callahan. “Misalnya, sering kali didominasi oleh satu spesies Lactobacillus, yang menciptakan lingkungan yang mengecualikan bakteri lain. Jika tidak ada, Gardnerella ada di sana. Jadi bagaimana bakteri ini berinteraksi?

"Jawaban atas pertanyaan-pertanyaan ini dapat menghasilkan pengobatan BV yang lebih efektif dan cara untuk memprediksi serta mencegah kelahiran prematur. Pekerjaan ini merupakan langkah penting dalam proses tersebut."