Gejala lupus eritematosus sistemik ditandai dengan polimorfisme yang jelas, tetapi hampir 20% anak-anak memiliki varian monoorgan pada onset penyakit. Perjalanan lupus eritematosus sistemik biasanya bergelombang, dengan periode eksaserbasi dan remisi yang bergantian. Secara umum, lupus eritematosus sistemik pada anak-anak ditandai dengan onset dan perjalanan penyakit yang lebih akut, generalisasi yang lebih awal dan lebih parah, dan hasil yang kurang baik dibandingkan pada orang dewasa.